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　　1、BLUP育種法的優點 BLUP育種法在目前無疑是世界上最先進的育種方法之一。

　　(1)它校正了環境效應，使我們的選種更有效、更準確。

　　(2)它數據收集更廣泛，使全國豬場的測定數據可以放在一起進行比較，有利整體水平的提高。

　　(3)它優中擇優，能最快地提高優良性狀。

　　(4)育種軟件的開發應用，使我們操作更方便、快捷等等。

　　2、BLUP育種法的不足

　　BLUP育種方法(包括以前其它的育種法)以國內大型場是很難勝任的，其原因如下：

　　(1)這些養殖場都是以利益為目的的，所以他們以市場為導向，以滿足客戶的需求為宗旨，一旦育種工作和這些發生沖突時，他們便會棄育種于不顧。例如，BLUP育種法所要求的測定數據在豬只體重達到80-105KG時進行，但當市場行情好時，這些豬往往在50KG左右便出售了。再如，背膘厚度在BLUP育種中是一個很重要的性狀，但由于背膘厚與日增重、產仔數等性狀都呈負相關，所以在養殖場中也就不那么重要了。

　　(2)在眾多疾病日益復雜的今天各養殖場在疾病困擾中是終日惶恐不安，對育種工作的關注恐怕是不怎么熱心了。

　　(3)既便是他們有心搞好育種工作，但是家丑不可外揚的心理難免讓他們對自己場發布的測定數據是慎之又慎。

　　(4)BLUP育種講究的是大群測定，以選擇指數的依據，優中擇優，但是俗話說金無赤金，那些指數很高的個體很多會有體型、奶頭、四肢或睪丸等方面的缺陷，讓我們很難決擇。

　　BLUP育種終歸是同品種內的選擇，而同一品種的遺傳基礎是大致相當的，所以選擇差也就十分有限，提高的程度也就不那么讓人期待了。我個人的觀點是：BLUP育種方法可以有效地提高我國豬的整體水平，但要想培育出令世界矚目的知名品牌還是有一定難度的。我時常想外國人知道導入我們太湖豬的基因以提高他們豬的繁殖性能，而我們為什么對我們自己那么多寶貴的資源視而不見呢?

　　育種軟件還不是很完美，操作過程中常出現這樣或那樣的問題，造成相對選種盲目，應多一些這方面的培訓，特別是對從事具體操作的技術人員進行全方位的培訓，我認為是很重要的。