稚鱉溫室養殖水質的調控是整個養殖過程中的重要因素。水質調控的好壞，可以直接影響到稚鱉的生長、產量、品質和養殖效益，溫室水質相對與外塘而言有所不同，有不見陽光、水體偏小、水質不穩定等不利因素。
一、稚鱉溫室養殖水質的基本要求和原則
1、理化指標的要求：水源無污染，水色咖啡色或者紅棕色為宜：PH7.08.0，亞硝酸鹽低于0.15mg/L，氨氮低于5mg/L，硫化氫低于0.5mg/L，溶解氧3 5mg/L。
2、小肥大瘦原則：3個月以下的稚鱉池水質盡量肥些，3個月以后的稚鱉池盡量瘦些。實踐經驗證明，池體1/5的水是清的為好。水體肥瘦的調節可以通過肥水或凈水措施調節。目前常用的是用中藥五倍子20-30ppm，煎煮后潑灑來達到肥水或市售肥水產品來肥水：潑灑水質改良劑或換水來達到凈水目的。
3、消毒：定期和不定期兩種方法。一般3個月以內的稚鱉每月消毒一次；3個月以后稚鱉池每月消毒2-3次；另外根據每個池體不同，可以適當調節消毒的時間和次數。消毒劑主要選用聚維酮碘、濃戊二醛、生石灰、氯制劑等，最好交叉使用，另外根據水體具體情況選擇合適的消毒劑。
二、水體理化指標的調控
1、PH值的調控稚鱉養殖水體適宜的PH值為7.0-8.0，PH值過高會增加氨氮的毒性，PH偏低，鱉攝食不旺，造成餌料系數偏高，嚴重的會引發中毒、出現腐皮病癥，對養殖影響比較大。
PH值偏低通常采用的解決方法是潑灑生石灰或小蘇打，PH值低于7.0時，用生石灰30-40ppm，或者用小蘇打100-150ppm調節；PH值偏高時，一般采取加大增氧，適當換水或者潑灑PH調節劑的辦法來處理。
2、氨氮的調控可以通過控制飼料投喂，潑灑降氨氮制劑及增氧劑或換水來消除。
3、亞硝酸鹽的調控降解亞硝酸鹽時應該結合鱉的吃食情況、水體的PH值、溶解氧等情況綜合來考慮。目前降解亞硝酸鹽的方法很多，養殖戶應該根據自己水體的情況來采取合適合理的辦法，一般三個月以下的稚鱉池，可以采取減少增氧、潑灑免疫多糖加維生素C，潑灑1-2次；三個月以后的稚鱉池可以采取潑灑大蘇打或者潑灑微生物制劑來處理，可以根據實際情況潑灑1-2次。
4、溶解氧的調控稚鱉池氧氣的控制是很有講究的，溶解氧過高可引起稚鱉氣泡病，稚鱉放養密度在30只/平方米左右采用1.1千瓦的增氧機，通常第1-2月每天增氧1-6小時，第3-4月每天增氧6-12個小時，第5-6月每天增氧12-18小時，6個月以后開始全天增氧。養殖過程中可以使用增氧劑等調節，溶解氧的調控應根據實際情況，控制增氧時間，靈活掌握。
三、微生物的作用
在水體中使用有益微生物制劑，可以加速水體的氨氮轉化為硝酸鹽，硝酸鹽則被浮游生物有效利用，從而有效改善水質及底質環境；同時由于高劑量投入，有益菌群在水體中短時間內形成優勢種群，抑制了其它病原微生物的繁殖，可以將繼發性感染源控制在較低水平，從而間接控制了鱉傳染性疾病的發生和發展，微生物制劑不能與消毒劑和抗菌藥同時使用，一般用藥5天后等藥效基本消失后再使用，使用過程中加紅糖0.5千克，曝氣24小時后傾倒在水池的一個角落即可。
按不同用途應使用不同類型的微生物制劑，如需降低水體氨氮、亞硝酸鹽、硫化氫等有害物質，應使用含硝化細菌、光合細菌為主的具凈水作用的微生物制劑，如需促進藻類繁殖，應使用含芽孢桿菌、酵母菌、乳酸菌為主的具肥水作用的微生物制劑，如需抑制有害細菌，應使用含鏈球菌、乳酸菌為主的微生物制劑。
目前溫室中使用微生物制劑還不夠廣泛，其主要原因是有一些菌種在溫室水體中不能形成優勢種類；但對于溫室水質調節來說，使用微生物制劑是一個大的發展方向。
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