實施疫病監測與凈化，從源頭上控制疫病的傳播與流行是最有效的措施。
1.合理使用獸藥要努力提高喂養管理水平，增強鴨的抵抗力，盡可能使鴨少生病，以減少用藥。通過正規渠道購買正規廠家生產的合格獸藥，并嚴格按規定使用。盡量使用無公害、無殘留的抗生素替代藥，如中草藥制劑、防御素、卵黃抗體等。嚴格執行休藥期（休藥期是指從停止給藥到允許動物或其產品上市的間隔時間）。注意擬定科學的給藥方案。要嚴格按療程給藥，正確用藥，防止藥物配伍禁忌，建立藥物使用檔案。
2.慎用消毒劑 根據消毒目的選擇消毒劑，應選擇高效、低廉、使用方便、對人與家禽安全、無殘留毒性，并且在禽體內不產生有害物質的消毒劑。反復消毒時最好選用兩種以上化學性質不同的消毒劑。
3.環境衛生要求鴨場內要保持環境清潔衛生，垃圾、糞便、病死鴨要及時清運出場或做無害化處理。隨時清掃鴨舍，保證光照充足、空氣清新、溫度適宜。做好滅鼠工作，場內不得喂養其他家禽、家畜。鴨場應設有病害禽尸無害化處理設施，以及糞便、污物發酵池等，這些設施應建造在種鴨場下風向處。
4.以防為主，防重于治無論是在鴨場設計建造、鴨苗引入，還是在喂養管理的整個過程中，都必須從消滅傳染源、切斷傳播途徑、增強鴨的抵抗力3個環節著手，嚴防傳染病的發生。如不從疫區引種，采用全進全出制喂養工藝；對進出場區人員、車輛進行防疫消毒，建立種蛋、雛鴨消毒程序與飲水及飼料消毒程序等。
5.鴨群免疫 種鴨喂養周期較長，對種蛋孵化與雛鴨成活影響大，應隨時監測鴨群抗體水平，根據監測結果及鴨群狀態確定是否進行免疫注射。對于非種鴨的防疫可按獸醫防疫部門推薦的防疫程序進行。
