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　　農藥殺菌劑主要用于防治植物病害。按作用方式又可分為：

　　①保護劑：農藥殺菌劑在病原菌侵染之前噴施在植物體表面，起保護作用，即使病菌再來也侵染不了植物。如波爾多液、福美類和代森類及有機硫殺菌劑等。

　　②治療劑：農藥殺菌劑在病原菌侵染植株以后施用，可以抑制病菌生長發育甚至致死，可以緩解植株受害程度甚至恢復健康。有經典治療作用的農藥殺菌劑是內吸劑，如多菌靈、三環唑、丙環唑、井岡霉素等均具有很強的內吸治療作用。而甲霜靈和三乙膦酸鋁這樣的內吸殺菌劑具有向頂性與向基基雙向內吸傳導作用。發揮治療作用特別優越。

　　③鏟除劑：農藥殺菌劑直接接觸植物病原并殺 傷病菌使它們不能侵染植株。鏟除劑因作用強烈，有的不能用在生長期的植株；石硫合劑藥液濃度高時具有鏟除作用，如在桃樹萌芽前施藥，可殺死枝干上的桃縮葉病菌。

　　施藥時間一長，病蟲易產生抗藥性。所謂病蟲抗藥性，指病蟲的一個品系在有藥劑的環境下，形成耐受農藥常用的劑量，而這個農藥劑量對正常種群中大多數敏感個體仍然有效，那就說明該個體有了抗藥性。對農藥殺菌劑而言，病菌對保護性殺菌劑(如硫磺、福美系列、代森錳鋅、波爾多液等)不易產生抗藥性，而對內吸性殺菌劑（如多菌靈、甲托、三唑酮、甲霜靈、丙環唑、抗菌素等）很容易產生抗藥性。這是因為保護性殺菌劑對病菌的生命活動的抑制是多位點作用，一種病菌不可能在全部位點引起突變。而內吸性殺菌劑對病菌的作用點是單一的，藥劑只針對病菌的單一代謝環節，病菌很容易在此作用點發生突變。