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因為銀杏具有生理后熟現象，采收后必須經過40～50  天的時間，才能完成胚的發育，達到完全的生理成熟，所以一定要在貯藏中給其創造良好的環境條件，促進胚的發育。常用的方法有：

一、帶外種皮貯藏法

將采收后外種皮完好無損的種實攤放在通風向陽的場地晾曬，每晚翻動一次，等3～5天后外種皮水分大部分失去而呈皺折狀時，裝入麻袋放在室內通風處。也可用1 體積種子加2體積河沙（沙的含水量為5%）混勻后，堆放在室內通風處，高20～30cm。貯藏中15～20天翻動1次，控制河沙干濕度，過干時應適當灑水增濕，發現霉爛種子，立即剔除。

二、砂藏法

種實采收后，堆積或泡在水里數天，使外種皮爛熟后，淘洗干凈，去掉雜質和浮果，陰干3～5天后與干凈的濕砂（黃砂或河砂均可，一定要淘洗干凈）混在一起，種子與濕砂的體積比為1：3～4，堆放在室內通風處，高度不超過50cm。砂的濕度以握在手里成團，水不從指縫中滲出，手放開后砂團散開為適宜。貯藏中每月要翻動1～2次，定期檢查防止高溫和砂過干或過濕，并注意防鼠害。這是最安全、常用的方法。

三、窖藏法

大面積育苗時，種子數量多，則選背陰、地形較高、排水良好地挖地窖貯藏。窖深、寬各0.8m，長度隨種子數量而定。窖底鋪10cm干凈濕河沙，窖中每隔1m 豎立窖內，至離地面20cm處，蓋上濕沙。再填細土堆成尖頂，蓋上草簾。窖的四周挖好排水溝，防止雨水流入。氣溫高于-5℃，封凍前每隔7～10天扒開檢查1次，封凍后每隔2～3周扒開檢查1次，揀出霉爛的種子。

四、水藏法

少量干凈的種子可直接浸入清水池中，種子高度不超過20cm，水面高出5cm，2～3天翻動1次，3～5天換1次水。

五、干藏法

少量干凈種子陰干后，裝入麻袋或編織袋內，平放在室內干燥通風處，每袋25～50kg，經常打開檢查，去除發霉的。