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　　肉眼檢查（簡稱目檢）是診斷魚病的主要方法之一。用肉眼找出病魚患病部位的各種特征或一些肉眼可見的病原生物，從而診斷魚患了什么病。對魚體進行目檢的部位和順序是體表、鰓和內臟。具體方法為：
　　體表檢查
　　將撈出的活病魚或剛死不久的病魚放在魚盤或白瓷盤中，對頭部、嘴、鰓蓋、鱗片、鰭條進行仔細觀察，看是否有大型病原生物，就要根據患病部位的癥狀來辨別，并把觀察到的癥狀聯系起來加以綜合分析。如魚體發黑，口腔充血，背部肌肉發紅，剝皮肌肉出血，鰭基充血，肛門紅腫，為病毒性出血或腸炎；頭部烏黑，鰓蓋骨腐蝕成小洞或鰓絲發白腐爛，為爛鰓病；鱗片脫落，鰭條斷折，體表充血、發炎，為赤皮??；尾柄及腹部兩側出現腐爛成指印狀的紅斑，由外部爛入，為打印??；病變部位發炎、膿腫，有浮腫感覺，潰瘍部由肌肉內部爛出，表皮完好，為癤瘡??；生有舊棉絮狀白色物，為水霉??；表現出眼睛混濁，有白內障，為復口吸蟲??；病變部位發白，為白皮病；部分鱗片發炎紅腫，呈紅點，有針狀蟲體，為鐵錨蟲??；形似臭蟲狀的蟲體則為鲺；２齡青魚腹部膨大，鰓絲發白，貧血，為球蟲病；肛門紅腫，為腸炎病；鳙腹部膨大，眼睛突出，為血居吸蟲病；魚下唇突出，無其他癥狀，為缺氧浮頭嚎死；魚眼球突出，鱗片松立，一般為池水有毒所致。
　　鰓部檢查
　　鰓部的檢查，重點是鰓絲。首先應注意鰓蓋是否張開，然后用剪刀剪去鰓蓋，觀察鰓片的顏色是否正常，粘液是否較多，鰓絲末端是否有腫大和腐爛現象。如是細菌性的爛鰓病，則鰓絲末端腐爛，粘液較多；鰓霉病，則鰓片顏色比正常魚的鰓片顏色較白，略帶血紅色小點；如是口絲蟲、隱鞭蟲、車輪蟲、斜管蟲、指環蟲和三代蟲等寄生蟲性疾病，則鰓片上有較多粘液；如是中華鮐、狹腹鮐、雙身蟲、部分指環蟲、以及粘孢子蟲囊等寄生蟲，則常表現鰓絲腫大，鰓蓋張開等病狀。
　　內臟檢查
　　內臟檢查以腸道為主，將病魚一邊的腸壁剪開，先觀察是否有腹水和肉眼可見的寄生蟲（如線蟲、雙線絳蟲等），其次應仔細觀察各內臟的外表，看是否正常，最后用剪刀把咽喉部的前腸和肛門部位的后腸腸道剪斷，取出內臟，置于白瓷盤中，把肝、脾、膽、鰾等器官逐個分開，再把腸道從前腸至后腸剪開，分成前中后３段，置于盤內。把腸道中的食物、糞便除去，仔細觀察腸道中是否有吸蟲、絳蟲等。腸壁上是否有粘孢子蟲胞囊或球蟲，若有則會在腸壁上有成片或稀散的小白點。腸壁是否充血、發炎、潰爛等。
　　肉眼檢查時主要以病狀為依據，但往往有這樣的情況：一種病由幾種病狀同時表現出來，例如腸炎病，有鰭條基部育血、蛀鰭、肛門紅腫、腸壁充血等病狀；另一種情況為一種病狀在好幾種病中都同樣出現，如體色變黑，鰭條基部充血、蛀鰭等，這些病狀是細菌性赤皮、癤瘡、爛鰓、腸炎等病所共有。因此，在目檢中，應做到認真檢查，全面分析，并做好記錄，為診斷魚病提供正確的依據，亦為以后的診斷工作積累資料。另外還要注意，肉眼檢查時要取將死未死或剛死不久的新鮮病魚來檢查。否則，如組織腐爛、炎癥消退、病原解體，則較難作出診斷。