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優良的平菇菌種，菌絲潔白、粗壯、密集，菌絲生長均勻、整齊，呈粗羊毛狀，爬壁性強。培養半個月左右，在瓶壁內可形成少量珊瑚狀的小菇蕾或白色原基。多數品種在培養基上方表面形成絨毛狀氣生菌絲，低溫品種氣生菌絲常分泌黃褐色色素，特別是在高溫季節，低溫品種常出現紅褐色或黃褐色的氣生菌絲或黃水，這屬正常現象。若培養基上方出現大量珊瑚狀子實體或從瓶蓋縫隙處長出子實體，說明菌齡過大，應盡快使用。若培養基干縮，瓶底積存黃水，為老化菌種不能使用。上部菌絲稀疏、灰暗、無力、干癟，下部菌絲正常，說明初期培養溫度過高，通氣不良，或有細菌污染。如果出現黃、綠、桔紅色，說明已被青霉、木霉和鏈孢霉污染，必須淘汰。菌絲在瓶中生長一半左右，不再向下生長，說明培養基過干、過濕、過緊，可用上部正常菌種，不再繼續培養。