許多花農一提到病害防治就是“打藥”(噴農藥)、“打什么藥”、“打幾蓋、打幾匙”。然而，藥劑防治僅僅是病害防治的措施之一，如果田間操作管理不當，僅靠噴殺菌劑是不能經濟有效地控制好病害的。花卉為較高經濟價值的作物，其栽培理念也應跟著提升，在綜合管理的栽培模式中，病害管理為其中的一環，但卻不是獨立的一環，不能用只要有病噴藥即可的觀念來經營管理，只有綜合治理才能實現花卉病害的綜合防治。
病因
由非生物引起的病害，由于相互不傳染，所以稱為非傳染性病害，又叫生理病害。由真菌、細菌等病原生物引起的病害，是可以傳染的，稱為傳染性病害。
生理性病害的發病原因
溫度不適宜、光照不適宜、水分失調、營養條件不適宜、土壤鹽分過多、有害氣體和物質、土壤酸堿度不適宜等都會影響花卉的正常生長發育，導致病害發生。因此可知生理性病害靠“打藥”是不能有效防治的。
傳染性病害的發病原因
引起花卉病害的病原生物有真菌、細菌、病毒、線蟲、類菌原體、類病毒、寄生性種子植物等。而這些病病原生物對花卉的危害與否及危害的程度取決于病原生物、花卉本身和外界環境條件，由此可知僅靠“打藥”也是不能完全控制好傳染性病害的。
病原生物、感病性花卉和適宜的環境同時存在時病害才會發生、蔓延；如果大棚中有感病性花卉和病原生物，但沒有適合發病的環境條件，病害不會出現。所以病害防治的基本對策就是如何打破這個三角關系，使三者無法同時出現在栽培棚內，如降低病原生物密度甚至完全消滅，種植抗病品種，改變栽培環境等。
田間操作管理對病害防治的影響
大棚管理
炭疽病、細菌性病害等常發生在高溫多濕的環境，而灰霉病則發生在冷涼、潮濕的氣候下，通風不良的設施栽培，白粉病較易發生。因此栽培棚內溫度、相對濕度、通風狀況、光照、土壤濕度及ph值等環境因子的調控對病害的防治尤為重要。
經常保持大棚內的通風、透光是抑制病害發生的極為重要的外部條件。即使是嚴寒的冬季，每天中午也應揭側膜或開窗，以降低棚內和植株表面的濕度，否則到3月份，便會大面積誘發病害，如香石竹的眼斑病、葉斑病，非洲菊的灰霉病等。
低光照強度導致植株過度生長更易感病，夏季遮蔭以防止強光的損傷，但過度遮蔭又會使花的枝條較軟，光照強度應控制在適宜植株生長發育的程度。
植株管理
移栽、摘心等造成的傷口，均可成為病菌的侵入點，盡可能選擇晴天摘心，以利于傷口愈合，防止病原菌的侵入。在進行栽培操作如摘心，扦插時，工具應經常消毒，盡量避免通過手指及工具傳播病菌。
合理調節株行距，可有效減少病害的發生。
灌溉管理
滴灌、溝灌或近土面的給水，避免因灌溉水飛濺，將病原菌胞子或細菌帶到健株上，才可有效控制病害發生。注意不可讓水份滯留在花瓣或葉面，雖為極少許的水分，卻是大部份病原菌發芽、侵入植株組織及繁殖不可缺少的重要因子，再者若遇到烈日高溫時，也易造成灼傷。
土壤濕度太高會造成土中含水量氧量降低，二氧化碳濃度升高，促進造成根腐之病原菌對根部的危害，而土壤濕度太低，由rhizoctonia所引起的苗期立枯病較嚴重。另外，離地栽培也是防止疫病發生的一種栽培方式。
施肥管理
植株生長需要養分，但施用過多的肥料反而對植株造成危害，ec值過高及肥害造成的植株黃化，生長不良等問題也經？梢姟７柿戏N類的選擇，需根據花卉種類而異，不同種類的花卉對養分的需求會有差異。植株長勢的強弱，也會影響病害發生的機率。
衛生管理
田間衛生可以說是最簡單、最有效的防治對策。將病株、病葉、雜草摘除，并帶離栽培場加以燒毀，可降低甚至完全清除場內病原菌密度，不能將植物殘體堆積于基地某個地方，任其腐爛，因這些殘體將成為病菌滋生的溫床，靠風力吹送飛濺，增加健株感病的機會。
細菌性病害、病毒病或枯萎病等系統性病害，其病原一旦侵入植株體內，便不易防治，應盡早將感病株全株拔除(連同根圈土壤或基質)，并帶離栽培場加以燒毀，才可避免病害的蔓延。如果只剪除出現病征部分枝葉，不但無法達到抑制蔓延的目的，病原物可能會由修剪的工具或根對根的接觸，傳染鄰近健康植株，無形中使清除病組織的修剪工作變成病原菌接種工作，反而加速病害的蔓延。再說，干干凈凈的栽培環境，不但易于管理，且看起來心曠神怡。
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