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　　1. 常規品種的種子生產
　　從田間選生長健壯、無病蟲害且具有本品種特征的番茄植株作為種株。種株與其他品種應隔10米以上，以防天然雜交。選種株的第二、三穗果，每穗選留4個果實采種。在果實充分紅熟后，選果形整齊、色澤鮮艷、符合品種性狀的采收。采收后放置在23℃左右的環境中5～7天，擠出種子，任其自然酸化3天，使種子上的膠狀物質溶解后洗凈曬干。
　　2. 一代雜種的種子生產
　　番茄制種時注意親本的選擇，如培育早熟品種，親本中必須有1個早熟品種；如培育豐產品種，親本中必須有1個高產品種。番茄花多數在上午開放，1朵花從開放到凋落歷時4～5天，雌花的受精能力可保持5～8天，但以當天開放的番茄花授粉效果最好。
　　第一步：選花序和花朵。雜交親本選用第二、第三花序，留靠近花序基部發育正常的2～4朵花作雜交用，花序基部已開放的花和上部瘦小的花要及時摘除。
　　第二步：去雄。在花瓣伸長后期，花粉未成熟之前去雄（花瓣沒展開前），去雄時用左手托住母本花基部，右手用鑷子輕輕將花瓣撥開摘除花藥，注意不要碰傷子房和花柱，去雄后立即套紙袋隔離。
　　第三步：花粉采集和保存。在父本花開放花粉還沒散出時，于早晨露水干后采集花粉。方法是將花朵攤開放干燥后輕輕敲打，使花粉落在盛裝的容器里，未裂開的花粉囊可先拔開再輕敲打。花粉取出后在低溫干燥避光處可保存2天。
　　第四步：授粉。去雄后2～3天母本花已完全開放，柱頭上分泌有黏液時，可在無風天氣的上午8～10時進行授粉。先將隔離紙袋取下，再用毛筆蘸取花粉輕輕向母本花柱頭涂抹，最后將隔離紙袋套上并記上授粉日期。
　　第五步：種子采收。授粉后第六天，可將紙袋摘掉，并在采種果上做上標記。在采種果充分紅熟時采收擠出種子。