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　　 有許多因素影響硫肥的肥效。這些因素對肥料效率的影響取決于所涉及的肥料物料的種類、土壤性質、作物種類、氣候條件以及施用時間。
　　
　　——元素硫
　　
　　由于作物以SO42-的形式吸收硫，所以硫在它被吸收之前必須經過生物氧化。元素硫通過微生物氧化轉化成SO32-。硫的生物氧化速率取決于3個因素的相互作用；（1）土壤中的微生物種群量；（2）硫磺的特征；（3）土壤的環境條件。
　　
　　土壤微生物：3類細菌參與硫的氧化，第二類硫細菌利用無機硫氧化中釋放出的能量將CO2固定為有機物。最重要的自養硫細菌是THIOBAULLI它幾乎主宰了土壤中所有的硫氧化過程，而且在一定的環境條件下十分活躍。
　　
　　第二類硫氧化微生物是光合硫細菌Phofolifhfrophic，它利用S2-和硫作為氧化劑受體進行光合作用。第三類，是一般異氧型微生物，它們是某些土壤中數量大作用強。硫的氧化作用在作物根際較強，因為在作物根際比非根際土壤有更多和更廣的硫氧化微生物群體。某些土壤中硫氧化生物體分布稀少。使用元素硫后，氧化速率較低因為建立起硫氧化微生物菌群需要一些時間。
　　
　　土壤環境條件：在30℃以下，溫度的提高使硫氧化速率增大。不同的硫氧化生物體最適宜的自然界溫度不相同。但對于大多數硫氧化生物體而言，溫度在25-40℃之間是理想的。
　　
　　硫氧化細菌大多是好氧菌。如果由于土壤浸水而缺少O2，它們的活性會下降。土壤濕度水平接近田間持水量時對硫氧化最有利。干燥的土壤仍保有使硫氧化的能力，但是在重新濕潤之后到它們重新恢復完全的能力有一個延遲期。一般說，微生物對硫的氧化作用在較寬的土壤pH值范圍內都可發生，盡管某些硫細菌最佳 pH值可以是4.0或更低。硫氧化微生物對土壤養分的需要與植物相同。它們會與作物爭奪養料。所以施肥土壤中硫的氧化作用更快。硫桿菌需要NH4+，而 NO3-有時會對它有傷害。有機物對于自養硫細菌的活性不是必不可少的。但是異氧型微生物需要有機物作為能量的來源。
　　
　　硫氧化作用受硫磺顆粒大小、施用的方法和時間影響。硫顆粒的表面積與種值于缺硫土壤中玉米時硫的攝取量之間的關系幾乎成理想的線性關系。
　　
　　—— 硫酸鹽
　　
　　不管施用于土壤的硫肥是什么形式，在通氣良好的土壤中最終產物總是SO42-。SO42-會與陽離子、例如土壤中的Ca2+形成溶解度很小的鹽類。硫酸鹽與土壤中的CaCO3形成共沉淀對植物是相對不易吸收的，而它是石灰質土壤中總硫的重要部分。由于硫酸根是陰離子溶解度大，SO42-很容易通過淋溶流失。在濕度大的地區，SO42-通常淋溶到下層土壤并可能在其中積聚。但是，可溶的SO42-鹽類常常淋溶到根區以下。
　　
　　許多高度風化的土壤具有相當高的SO42-吸附能力。但是，這一反應是可逆的。作物可以利用吸附的SO42-。SO42-的吸附通過減少淋溶流失和控制SO42-向作物根部以外的地方遷移，有助于保存硫肥和土壤本身的硫。高度風化的土壤中吸附的SO42-對硫的需求有很重要的貢獻，因為在表土中被吸附的SO42-通常不到總硫的10%，但是在下層土壤中吸附態硫可占總硫的1/3。
　　
　　土壤對硫酸根的吸附決定于溶液中硫酸根的濃度。使用含硫肥料后土壤溶液中SO42-濃度增大從而增強SO42-的吸附。施撒過石灰和磷酸鹽肥會降低土壤吸附SO42-的能力。這些措施在短期內可提高土壤中硫酸鹽的含量，但長期效應而言，很可能由于流失更多而加速表土中硫的衰竭。硫酸鹽吸能力還隨著土壤中粘土的含量增加而提高。一般說，粘土礦物對SO42-的吸附遵循以下次序：高嶺土>伊利土>蒙脫土。水合氧化物，象Al和Fe的氧化物在許多土壤中起著吸附大部分SO42-的作用。
　　
　　一般而言，種植于砂質土壤上的作物較容易缺硫，因為這些土壤的有機物和粘土含量常常較低，導致SO42-容易流失 特別是在降雨量大的地區。在這樣的條件下，硫磺肥料可能比硫酸鹽速效肥料更好。在某些地區，可能需要既含有SO42-又含有元素硫的肥料，以便延長作物可攝取硫的時間。這些措施在一些濕度大的地區被采用。
　　
　　在某些C/S比或N/S比高的土壤中也可能發生硫的固定作用. 而C/S比或N/S比低的土壤則有利于硫的礦化作用（無機鹽化）。因而一般土壤機物含量高 硫的有效性也高。種植于有機物含量小于1.2%-1.5%的土壤上的谷物常需施用硫肥。
　　
　　硫酸鹽在高度嫌氣土壤中可被細菌還原形成H2S，隨后再與重金屬反應而生成高度不溶性的硫化物。如果土壤系統后來被氧化，這些硫化物氧化成元素硫，再通過生物氧化過程轉化為H2SO4，引起土壤酸化。