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由于克氏螯蝦養殖剛剛起步，研究克氏螯蝦病害的時間較短，目前對許多問題尚未完全了解，特別是病毒性疾病，至今仍不能有效治療。對待蝦病應立足于“無病先防、有病早治、以防為主、防治結合”的十六字方針。下面介紹一些克氏螯蝦常見病害的防治方法。
　　爛鰓病  病原為細菌。癥狀為病蝦鰓絲發黑，局部霉爛。
　　防治方法：(1)經常清除蝦池中的殘餌、污物，注入新水，保持水體中溶氧在4毫克/升以上，避免水質被污染。(2)每立方米水體用漂白粉2克溶水全池潑灑，可以起到較好的治療效果。
　　黑鰓病  此病主要是由于水質污染嚴重，克氏螯蝦鰓絲受霉菌感染引起。癥狀是鰓由紅色變為褐色或淡褐色，直至完全變黑，鰓萎縮，病蝦往往伏在岸邊不動，最后因呼吸困難而死。
　　防治方法： (1)保持水體清潔，溶氧充足，定期用生石灰調節水質。(2)患病蝦用3%～5%的食鹽水浸洗2～3次，每次3～5分鐘；或每立方米水體用亞甲基藍10克溶水全池潑灑。
　　爛尾病  爛尾病是由于克氏螯蝦受傷、相互殘食或被幾丁質分解細菌感染引起的。感染初期病蝦尾部有水泡，邊緣潰爛、壞死或殘缺不全，隨著病情的惡化，潰爛由邊緣向中間發展，嚴重感染時，病蝦整個尾部潰爛掉落。
　　防治方法：(1)運輸和投放蝦苗蝦種時，不要堆壓和損傷蝦體。(2)飼養期間飼料要投足、投勻，防止蝦因飼料不足相互爭食或殘殺。(3)發生此病，每立方米水體用茶粕15～20克浸液全池潑灑；或每畝水面用生石灰5～6公斤溶水全池潑灑。
　　聚縮蟲病  病原為聚縮蟲，癥狀為克氏螯蝦難以順利脫殼，病蝦往往在脫殼過程中死亡，幼體、成蝦均可發生，對幼蝦危害較嚴重。
　　防治方法：(1)徹底清塘，殺滅池中的病原體。(2)發生此病可經常大量換水，減少池水中聚縮蟲數量。
　　纖毛蟲病  常見病原有累枝蟲和鐘形蟲等。纖毛蟲附著在成蝦和蝦苗的體表、附肢和鰓上，大量附著時會妨礙蝦的呼吸、活動、攝食和脫殼，影響生長。尤其在鰓上大量附著時，影響鰓絲的氣體交換，會引起蝦體缺氧而窒息死亡。
　　防治方法：(1)保持合理的放養密度，注意蝦池的環境衛生，經常換新水，保持水質清新。(2)用3%～5%的食鹽水浸洗病蝦，3～5天為一個療程；(3)用25～30毫克/升的福爾馬林溶液浸洗4～6小時，連續2～3次。